在1999年1月22日,为了适应WRC新的赛例规定,Evo.6正式問世。相比起Evo.5,Evo.6的改进重点放在了车身的外形设计上,重新设计的头唇,前保险杠等空气部件给人全新的视觉感受,不对称的进气口设计和双层可调尾翼更是酷味十足,个性到死。此外,针对前一代车架刚性稍有不足的弱点,Evo.6严谨地补强了车架。在悬挂套件上则全面启用锻造铝材,既保证了耐用性又减轻了整体重量。最大马力和最大扭矩均维持不变,与Evo.5相同,分别为280ps和38kgm。 顺便一提全球限量仅2000部的Evolution Tommi Makinen Edition,这款为了纪念Tommi本人在WRC中四连冠的“6代半”Evo其实就是在Evo.6少做一点改进得来的,外形的空气动力套件有所不同,车内的座椅,标记等等都是Tommi版独有的。性能表现与Evo.6完全一样:强!
在发动机方面,Evolution IX采用的4G63发动机,运用MIVEC正时可变气门技术令燃油效率大幅提升,根据日本10-15种道路模式的测试,GSR车型平均油耗在每10km还有1升,相当于提高了3%的效率。在日本车型的三个级别中,GSR发动机峰值扭矩为400Nm,而同采用全新涡轮增压器的GT和RS发动机峰值扭矩为407Nm。新车的悬挂系统,将沿用来自Evolution VIII MR所采用的Bilstein悬挂系统。